Para aumentar a autonomia da instalação alimentada pela micro rede, nomeadamente quando não houver vento, e a energia solar não for suficiente recorre-se a um gerador de biodiesel convencional, o qual vai funcionar a biodiesel proveniente da unidade de produção do IPB. A potência nominal do gerador é de 5kW.

O gerador entra em funcionamento de forma automática, quando a energia proveniente das fontes renováveis (eólica e solar) for insuficiente e a tensão das baterias for inferior a um dado valor, de modo a preservar o tempo de vida útil das baterias. Para o efeito, este gerador está equipado com um terminal ATS (Autromatic Transfer Switch) necessário para o comando automático.